Construida durante la época de la Colonia (entre los siglos XVI y XVII) la capilla de Santiago Apóstol fue uno de los monumentos históricos que resultaron dañados por el sismo del 19S en Totolapan, y actualmente se encuentra en proceso de restauración por parte de una empresa y la supervisión del Instituto Nacional de Antropología e Historia (INAH).
Durante el 19S, la comunidad de Nepopualco fue una de las que más afectaciones tuvo debido al sismo. Además de las casas que resultaron dañadas, la comunidad vio caer su capilla, edificada en honor a Santiago Apóstol y que actualmente está en proceso de restauración.
Previamente, un grupo de especialistas llevó a cabo la restauración del conjunto de piezas escultóricas que existían en el lugar, buscan devolverlas a su forma y apariencia original. Mientras tanto, los trabajos en el edificio, construido por la orden de los agustinos, continúan.
En esta capilla, así como en la de San Agustín, existen murales y piezas que contienen arte delicado en sus imágenes, pero que son vestigios que mantienen vivo el pasado de México.